冷凍電鏡數(shù)據(jù)計(jì)算存儲(chǔ)平臺(tái)建設(shè)項(xiàng)目是四川大學(xué)生物治療國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室冷凍電鏡平臺(tái)附屬配套工程，為今后冷凍電鏡大數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、計(jì)算、在線分析提供支持，項(xiàng)目包括高性能計(jì)算功能、大數(shù)據(jù)存儲(chǔ)與在線管理等設(shè)備的采購、后期各項(xiàng)應(yīng)用軟件的培訓(xùn)、以及機(jī)房環(huán)境改造與建設(shè)。項(xiàng)目建成后將成為冷凍電鏡平臺(tái)在線三維數(shù)據(jù)分析處理中心，為科研團(tuán)隊(duì)提供冷凍電鏡數(shù)據(jù)的在線計(jì)算和存儲(chǔ)、以及配套技術(shù)服務(wù)。

　　招標(biāo)內(nèi)容如下：

　　招標(biāo)公告中對(duì)項(xiàng)目的需求進(jìn)行了如下描述：采購、部署一套高性能計(jì)算集群，包含計(jì)算功能、存儲(chǔ)功能、在線數(shù)據(jù)處理功能、在線遠(yuǎn)程3DLinux 桌面云功能、校內(nèi)在線計(jì)算與存儲(chǔ)功能、集群管理與多用戶作業(yè)隊(duì)列管理功能、用戶存儲(chǔ)配額管理功能、配套機(jī)房設(shè)施/網(wǎng)絡(luò)/綜合布線系統(tǒng)工程與配套設(shè)施設(shè)備。計(jì)算與存儲(chǔ)功能配套的計(jì)算機(jī)性能要求見配置功能要求。供應(yīng)商必須提供集群系統(tǒng)的設(shè)計(jì)、實(shí)施、運(yùn)營維護(hù)、售后服務(wù)、駐場(chǎng)技術(shù)支持服務(wù)的詳細(xì)方案。

　　對(duì)于冷凍電鏡數(shù)據(jù)處理技術(shù)支持服務(wù)要求：供應(yīng)商必須針對(duì)冷凍電鏡數(shù)據(jù)采集、預(yù)處理、分析處理、三維重構(gòu)、數(shù)據(jù)三維可視化等環(huán)節(jié)設(shè)計(jì)、部署全自動(dòng)化數(shù)據(jù)處理流程(Pipeline)，包括但不限于數(shù)據(jù)收集軟件SerialEM、數(shù)據(jù)處理軟件(MotionCor2、CtfFind4、RELION3、EMAN、EMAN2、cryoSPARC、cisTEM)、Tomo 專用軟件(IMOD、EMClarity)、以及建模軟件(Coot、Rosetta、Phenix、Pymol、CCP4)等具體軟件的腳本編寫與軟件代碼級(jí)別性能調(diào)優(yōu)。