微生物可引起個(gè)體或群體的感染性疾病,近年來(lái)國(guó)內(nèi)外報(bào)道的重大公共衛(wèi)生事件,如超級(jí)耐藥細(xì)菌傳播、重癥急性呼吸綜合征(Severe Acute Respiratory Syndrome,SARS)流行、炭疽桿菌生物恐怖事件、分枝桿菌醫(yī)院感染等均由微生物所致。臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)可鑒定感染的病原菌種類(lèi)并檢測(cè)其對(duì)抗菌藥物的敏感性,在疾病的診斷、治療和預(yù)防控制等方面均具有重要作用。
然而,與其他檢驗(yàn)方法不同,微生物學(xué)檢測(cè)有其自身的特殊性和復(fù)雜性。
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第一,檢測(cè)的對(duì)象大多是活的微生物,離體后容易死亡,標(biāo)本需要及時(shí)處理;
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第二,標(biāo)本中的病原微生物是未知的,具有傳染性,存在生物安全隱患;
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第三,引起人類(lèi)感染的微生物種類(lèi)繁多,檢測(cè)方法復(fù)雜,對(duì)檢測(cè)人員的技術(shù)水平要求較高。
目前我國(guó)基層實(shí)驗(yàn)室存在儀器設(shè)備簡(jiǎn)單陳舊,檢驗(yàn)質(zhì)量缺乏保證,操作程序不規(guī)范,操作人員沒(méi)有受過(guò)正規(guī)培訓(xùn)等問(wèn)題。微生物學(xué)檢驗(yàn)是臨床檢驗(yàn)中的“短板”,一些二級(jí)醫(yī)院尚未建立微生物實(shí)驗(yàn)室或不能開(kāi)展必要的檢驗(yàn)項(xiàng)目。為了規(guī)范臨床微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室硬件和軟件建設(shè),中華醫(yī)學(xué)會(huì)檢驗(yàn)分會(huì)微生物學(xué)組委員和國(guó)家衛(wèi)計(jì)委臨床檢驗(yàn)中心專家共同討論制定了本共識(shí)。
一、環(huán)境和設(shè)備
(一)實(shí)驗(yàn)室面積和環(huán)境
臨床微生物實(shí)驗(yàn)室(以下簡(jiǎn)稱微生物室)應(yīng)有足夠的空間進(jìn)行試驗(yàn)操作和結(jié)果報(bào)告。根據(jù)我國(guó)目前的現(xiàn)狀,大多數(shù)微生物室僅從事細(xì)菌培養(yǎng)、鑒定和藥敏試驗(yàn),建議二級(jí)醫(yī)院使用面積最好不低于60m2,三級(jí)醫(yī)院不低于160m2(如果同時(shí)開(kāi)展感染性免疫檢驗(yàn),則面積相應(yīng)擴(kuò)大)。設(shè)置防蟲(chóng)紗窗和門(mén)禁,并按檢測(cè)功能進(jìn)行相對(duì)分區(qū),如分為標(biāo)本處理、涂片鏡檢、分離培養(yǎng)、鑒定/藥敏、培養(yǎng)基制備和結(jié)果報(bào)告等區(qū)域。三級(jí)醫(yī)院應(yīng)有獨(dú)立的分枝桿菌和真菌檢測(cè)室。實(shí)驗(yàn)室內(nèi)要有充足的照明,宜有適當(dāng)?shù)慕o排水管道、良好的通風(fēng)設(shè)施和完善的信息管理系統(tǒng)。
(二)儀器和設(shè)備
1.二級(jí)醫(yī)院微生物室必備的儀器設(shè)備有:生物安全柜、高壓消毒滅菌器、紫外燈、試劑冰箱、低溫冰箱、普通培養(yǎng)箱(至少2個(gè)溫度)、顯微鏡、比濁計(jì)、燭缸、離心機(jī)等。有條件或標(biāo)本量較多的醫(yī)院應(yīng)配備血培養(yǎng)儀、半自動(dòng)/全自動(dòng)微生物分析儀。
2.三級(jí)醫(yī)院微生物室必須增加配備的儀器設(shè)備有:血培養(yǎng)儀、自動(dòng)微生物分析儀、濁度儀、CO2培養(yǎng)箱、細(xì)胞離心機(jī)、熒光顯微鏡等。
根據(jù)標(biāo)本量和所開(kāi)展的檢驗(yàn)項(xiàng)目,有條件的微生物室可配備(但不限于):自動(dòng)染片機(jī)、標(biāo)本自動(dòng)接種儀、基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時(shí)間質(zhì)譜儀、基因診斷平臺(tái)(包括擴(kuò)增儀、測(cè)序儀等)、冷凍干燥機(jī)、化學(xué)發(fā)光儀、酶標(biāo)儀、洗板機(jī)等設(shè)備。
二、人員資質(zhì)
根據(jù)我國(guó)目前的現(xiàn)狀,二級(jí)醫(yī)院微生物室至少有固定人員2~3人,建議5人及以上,其中實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人至少為中級(jí)技術(shù)職稱,有臨床醫(yī)學(xué)或檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)習(xí)背景,并有在三級(jí)醫(yī)院微生物室進(jìn)修6個(gè)月以上的經(jīng)歷和3年以上臨床微生物工作經(jīng)驗(yàn),有持續(xù)學(xué)習(xí)的熱情和能力,且每2年至少外出學(xué)習(xí)或進(jìn)修培訓(xùn)1次。
三級(jí)醫(yī)院微生物室至少有固定人員6~8人,建議10人及以上,其中實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人至少為副高技術(shù)職稱,有臨床醫(yī)學(xué)或檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)專業(yè)本科或以上學(xué)歷,有5年以上臨床微生物工作經(jīng)驗(yàn),并有持續(xù)學(xué)習(xí)的熱情和能力,且每年至少外出學(xué)習(xí)或進(jìn)修培訓(xùn)1次。
進(jìn)入微生物實(shí)驗(yàn)室工作的人員應(yīng)經(jīng)過(guò)專業(yè)技術(shù)、醫(yī)院感染知識(shí)和生物安全培訓(xùn)。有顏色視覺(jué)障礙的人員不應(yīng)從事涉及辨色的微生物學(xué)檢驗(yàn)。從事特殊崗位檢驗(yàn),如性病、HIV、結(jié)核菌和基因擴(kuò)增檢驗(yàn)的人員應(yīng)通過(guò)相應(yīng)的崗位培訓(xùn),并具有上崗資格證。
?微生物室專業(yè)組長(zhǎng)應(yīng)對(duì)新入崗人員進(jìn)行培訓(xùn)、并定期(至少每6個(gè)月1次)對(duì)在崗人員進(jìn)行評(píng)估考核。對(duì)由多個(gè)人員進(jìn)行的手工檢驗(yàn)項(xiàng)目(如顯微鏡檢查、培養(yǎng)結(jié)果判讀、抑菌圈測(cè)量、結(jié)果報(bào)告等)應(yīng)進(jìn)行人員比對(duì)。
三、檢驗(yàn)技術(shù)
(一)二級(jí)醫(yī)院必備技術(shù)
?重點(diǎn)要求能夠通過(guò)染色鏡檢和分離培養(yǎng)等技術(shù)及時(shí)發(fā)現(xiàn)標(biāo)本中所存在的病原菌。
1.染色鏡檢:能夠進(jìn)行革蘭染色、抗酸染色、墨汁染色和乳酸棉酚蘭染色等,并識(shí)別常見(jiàn)病原菌。
2.細(xì)菌培養(yǎng):能夠采用手工方法或血培養(yǎng)儀對(duì)血液及無(wú)菌體液進(jìn)行增菌培養(yǎng)。能夠根據(jù)需要對(duì)各類(lèi)標(biāo)本進(jìn)行普通細(xì)菌培養(yǎng)、苛氧菌培養(yǎng)(可使用燭缸)、厭氧菌(可使用厭氧袋或厭氧罐)和真菌培養(yǎng)。
3.細(xì)菌鑒定:可采用全自動(dòng)、半自動(dòng)或手工方法(如編碼方法)對(duì)臨床常見(jiàn)的需氧菌、兼性厭氧菌、苛氧菌和酵母菌鑒定到種或?qū)俚乃?;?duì)于厭氧
菌可僅報(bào)告革蘭染色性和細(xì)菌形態(tài)。
4.藥敏試驗(yàn):能夠?qū)εR床常見(jiàn)細(xì)菌進(jìn)行規(guī)范化的藥敏試驗(yàn),并報(bào)告敏感/中介/耐藥結(jié)果。
5.免疫學(xué)檢測(cè):根據(jù)臨床需要和科室工作安排,可進(jìn)行病原菌抗原或抗體檢測(cè)(如肝炎病毒抗原抗體檢測(cè))。
(二)三級(jí)醫(yī)院必備技術(shù)(在二級(jí)醫(yī)院基礎(chǔ)上)
1.染色鏡檢:能開(kāi)展六胺銀染色、免疫熒光染色和其他特殊染色。
2.細(xì)菌鑒定:能夠?qū)⒎蛛x的細(xì)菌(包括分枝桿菌、常見(jiàn)絲狀真菌、厭氧菌)鑒定到種或?qū)偎健?/p>
3.藥敏試驗(yàn):能夠開(kāi)展苛氧菌、厭氧菌和酵母菌的藥敏試驗(yàn)。
4.非培養(yǎng)診斷技術(shù):根據(jù)臨床需求可使用PCR、基因測(cè)序、芯片、質(zhì)譜等技術(shù)進(jìn)行病原菌鑒定/分型/耐藥性檢測(cè)和同源性分析??砷_(kāi)展病原體血清免疫學(xué)檢測(cè)、降鈣素原、真菌-(1,3)-β-D-葡聚糖檢測(cè)、真菌半乳甘露聚糖檢測(cè)、結(jié)核T細(xì)胞斑點(diǎn)試驗(yàn)等項(xiàng)目。
四、質(zhì)量和服務(wù)
(一)檢驗(yàn)前程序
1.檢驗(yàn)申請(qǐng)單的設(shè)計(jì)和應(yīng)用:由于微生物學(xué)檢驗(yàn)的特殊性,所以檢驗(yàn)申請(qǐng)單除常規(guī)信息外還應(yīng)包括:標(biāo)本采集方法(如中段尿、導(dǎo)尿、膀胱穿刺尿等)、采集部位、采集時(shí)間、采集前是否已使用抗菌藥物、臨床擬診感染類(lèi)型和(或)可疑目標(biāo)菌等信息。
2.標(biāo)本采集的指導(dǎo)和培訓(xùn):通過(guò)編寫(xiě)《微生物標(biāo)本采集手冊(cè)》(供醫(yī)護(hù)人員使用),《痰、尿、便標(biāo)本采集和送檢須知》(供患者使用),配合多媒體及視頻宣傳等多種形式進(jìn)行標(biāo)本采集方法指導(dǎo)和培訓(xùn),提高有價(jià)值的標(biāo)本(如血液和無(wú)菌體液)以及合格標(biāo)本的送檢率,對(duì)不合格標(biāo)本應(yīng)及時(shí)反饋,并根據(jù)需要進(jìn)行溝通和再培訓(xùn)。
3.標(biāo)本運(yùn)送:
(1)所有標(biāo)本均應(yīng)視為有潛在生物危險(xiǎn),運(yùn)送過(guò)程中應(yīng)防止溢出;
(2)應(yīng)根據(jù)標(biāo)本中的疑似病原菌選擇適宜的運(yùn)送培養(yǎng)基和保溫措施;
(3)所有標(biāo)本均應(yīng)盡快運(yùn)送(在2h內(nèi)),特殊標(biāo)本(如厭氧培養(yǎng)標(biāo)本、腦脊液標(biāo)本)應(yīng)立即運(yùn)送。
4.標(biāo)本驗(yàn)收:除常規(guī)的驗(yàn)收程序以外,應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注:
(1)送檢標(biāo)本的容器是否為無(wú)菌、封閉、無(wú)泄漏;
(2)標(biāo)本類(lèi)型是否與申請(qǐng)項(xiàng)目相符合(如痰液標(biāo)本申請(qǐng)項(xiàng)目為厭氧培養(yǎng),則為不合格);
(3)肉眼觀察標(biāo)本性質(zhì)是否合格(如送檢的拭子已干燥,送檢
的痰標(biāo)本為唾液等為不合格);
(4)標(biāo)本送檢時(shí)間是否已超過(guò)允許范圍。對(duì)不合格的標(biāo)本應(yīng)及時(shí)進(jìn)行登記和反饋。
(二)檢驗(yàn)程序
1.染色鏡檢:
(1)能夠根據(jù)檢驗(yàn)申請(qǐng)、標(biāo)本類(lèi)型及可疑的病原菌種類(lèi)選擇正確的染色方法(如懷疑隱球菌性腦膜炎,選擇墨汁染色)。
(2)對(duì)痰標(biāo)本應(yīng)進(jìn)行涂片革蘭染色,判斷標(biāo)本質(zhì)量,觀察細(xì)菌分布。
(3)至少每周用已知的陽(yáng)性和陰性質(zhì)控菌株進(jìn)行1次質(zhì)控(若檢測(cè)頻率小于每周1次,則在實(shí)驗(yàn)當(dāng)日進(jìn)行質(zhì)控)。
2.細(xì)菌分離培養(yǎng):
(1)能夠根據(jù)檢驗(yàn)申請(qǐng)信息、標(biāo)本類(lèi)型及可疑的病原菌選擇正確的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件(如培養(yǎng)溫度、氣體環(huán)境和培養(yǎng)時(shí)間)。
(2)每一批培養(yǎng)基(包括自制或購(gòu)買(mǎi))均應(yīng)進(jìn)行質(zhì)量和性能驗(yàn)證(無(wú)菌試驗(yàn)、生長(zhǎng)試驗(yàn)、必要時(shí)做生長(zhǎng)抑制試驗(yàn)和生化反應(yīng))。記錄培養(yǎng)基制備過(guò)程(僅對(duì)自制培養(yǎng)基)、生產(chǎn)日期、有效期、外觀和性能驗(yàn)證結(jié)果。
應(yīng)在有效期內(nèi)使用。
(3)能正確判別各類(lèi)標(biāo)本在培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的有意義的結(jié)果。
(4)需要定量培養(yǎng)的標(biāo)本(如尿液、肺泡灌洗液)應(yīng)按要求接種,并進(jìn)行菌落計(jì)數(shù)。
3.細(xì)菌鑒定:
(1)能根據(jù)細(xì)菌菌落形態(tài)和涂片染色結(jié)果選擇適當(dāng)?shù)蔫b定試驗(yàn)項(xiàng)目,并采用適宜的方法將細(xì)菌鑒定到種。
(2)對(duì)細(xì)菌鑒定所需要使用的血漿凝固酶、觸酶、氧化酶試驗(yàn)及診斷性抗血清等至少應(yīng)在每個(gè)實(shí)驗(yàn)當(dāng)日做陽(yáng)性和陰性質(zhì)控。
(3)對(duì)細(xì)菌鑒定所需的其他生化反應(yīng)試劑至少應(yīng)在每一批次產(chǎn)品使用前做陰性和陽(yáng)性質(zhì)控,并在有效期內(nèi)使用。
4.藥敏試驗(yàn):
(1)能根據(jù)本單位條件及所檢測(cè)的病原菌種類(lèi)選擇紙片擴(kuò)散法、稀釋法、濃度梯度擴(kuò)散法(E試驗(yàn))或自動(dòng)化儀器法進(jìn)行抗菌藥物敏感性試驗(yàn)。
(2)試驗(yàn)過(guò)程應(yīng)遵循標(biāo)準(zhǔn)化操作方法或制造商建議進(jìn)行操作
(3)藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果解釋至少應(yīng)遵循上一年度CLSI藥敏試驗(yàn)的判斷標(biāo)準(zhǔn)。
(4)使用自動(dòng)化儀器進(jìn)行藥敏試驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)室應(yīng)按制造商的要求進(jìn)行質(zhì)控。
(5)應(yīng)定期(至少每1~2年1次)使用最新的CLSI文件標(biāo)準(zhǔn)對(duì)儀器的藥敏試驗(yàn)判斷折點(diǎn)進(jìn)行評(píng)估,僅報(bào)告符合文件標(biāo)準(zhǔn)的抗菌藥物藥敏試驗(yàn)結(jié)果,對(duì)評(píng)估不符合要求(如藥物稀釋度不包括藥敏判斷折點(diǎn)、折點(diǎn)設(shè)置錯(cuò)誤、檢測(cè)結(jié)果偏離)的儀器應(yīng)暫停使用,并與儀器供應(yīng)商溝通。
(6)使用紙片擴(kuò)散法進(jìn)行藥敏試驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)室應(yīng)按要求對(duì)每一批號(hào)的藥敏試驗(yàn)紙片進(jìn)行質(zhì)控,如果質(zhì)控在控,則改為每周質(zhì)控1次(若檢測(cè)頻率小于每周1次,則應(yīng)在每個(gè)檢測(cè)日進(jìn)行質(zhì)控)。
(三)檢驗(yàn)后程序
能夠?qū)Ω黝?lèi)標(biāo)本染色鏡檢和細(xì)菌培養(yǎng)鑒定結(jié)果進(jìn)行及時(shí)準(zhǔn)確的報(bào)告,并能進(jìn)行結(jié)果解釋,以及與臨床進(jìn)行良好的溝通。有檢驗(yàn)醫(yī)師的微生物室,可發(fā)出“臨床微生物檢驗(yàn)診斷報(bào)告”。
對(duì)各類(lèi)標(biāo)本培養(yǎng)陰性結(jié)果應(yīng)進(jìn)行規(guī)范報(bào)告:如血液增菌培養(yǎng)報(bào)告“培養(yǎng)5d無(wú)菌生長(zhǎng)”;膿液、引流液、腦脊液、穿刺液等培養(yǎng)報(bào)告“培養(yǎng)××小時(shí)無(wú)菌生長(zhǎng)”;咽拭子、痰液等報(bào)告“正常菌群生長(zhǎng)”或“未分離出致病菌”;糞便或肛拭子等報(bào)告“未培養(yǎng)出志賀菌、沙門(mén)菌”或“未培養(yǎng)出霍亂弧菌”等。
血液、腦脊液、骨髓等無(wú)菌體液標(biāo)本檢出細(xì)菌(鏡檢或培養(yǎng))應(yīng)分級(jí)報(bào)告,并按危急值報(bào)告和登記。
當(dāng)鑒定出高致病性病原微生物(如布魯菌、弗朗西斯菌)時(shí),應(yīng)按相關(guān)法規(guī)要求進(jìn)行上報(bào)和處理。
短時(shí)間(5~7d)內(nèi)在同一科室分離出3株或以上同種病原菌,或某種耐藥菌分離率異常增高時(shí)應(yīng)報(bào)告醫(yī)院感染管理部門(mén)。
對(duì)藥敏試驗(yàn)結(jié)果應(yīng)按規(guī)定進(jìn)行審核和報(bào)告,應(yīng)特別關(guān)注天然耐藥、罕見(jiàn)耐藥菌株和特殊部位分離的病原菌藥敏試驗(yàn)結(jié)果的審核和報(bào)告。
對(duì)醫(yī)院感染管理規(guī)定監(jiān)測(cè)的多重耐藥菌要進(jìn)行報(bào)告和預(yù)警。
應(yīng)定期(至少每年1~2次)對(duì)抗菌藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,并向醫(yī)院感染部門(mén)和臨床醫(yī)師通報(bào)。
?應(yīng)參加全國(guó)或地區(qū)性的耐藥監(jiān)測(cè)。
(四)儀器設(shè)備質(zhì)量控制和性能驗(yàn)證
對(duì)冰箱、培養(yǎng)箱和水浴箱至少每日觀察并記錄1次溫度;CO2培養(yǎng)箱應(yīng)每日記錄CO2濃度;紫外燈應(yīng)每日記錄消毒時(shí)間,應(yīng)定期(每6個(gè)月)監(jiān)測(cè)紫外線強(qiáng)度并監(jiān)測(cè)紫外燈消毒的效果。
壓力滅菌器應(yīng)每次使用化學(xué)指示劑,每周使用生物指示劑監(jiān)測(cè)滅菌效果。
細(xì)菌濁度儀至少每6個(gè)月應(yīng)進(jìn)行檢定或校準(zhǔn)1次。
?生物安全柜的高效過(guò)濾器、氣流和負(fù)壓等參數(shù),壓力滅菌器的壓力表以及卡尺、溫度計(jì)、濕度計(jì)、移液器的準(zhǔn)確性應(yīng)定期驗(yàn)證、檢定或校準(zhǔn)[4]。
(五)能力驗(yàn)證
按要求參加相應(yīng)的能力驗(yàn)證/室間質(zhì)評(píng)。應(yīng)對(duì)“不滿意”和“不合格”的能力驗(yàn)證/室間質(zhì)評(píng)結(jié)果進(jìn)行分析并采取糾正和預(yù)防措施。
?對(duì)沒(méi)有開(kāi)展能力驗(yàn)證/室間質(zhì)評(píng)的項(xiàng)目,應(yīng)至少每6個(gè)月與其他實(shí)驗(yàn)室(或其他試驗(yàn)方法)進(jìn)行1次性能比對(duì)評(píng)估試驗(yàn)。
五、生物安全
臨床微生物室屬于二級(jí)生物安全實(shí)驗(yàn)室,應(yīng)按照相關(guān)法規(guī)要求進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)和管理。
臨床微生物室應(yīng)定期(至少每年一次)進(jìn)行生物安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。
應(yīng)根據(jù)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估結(jié)果配備必要的生物安全防護(hù)設(shè)備,如生物安全柜、高壓消毒滅菌器、紫外燈、應(yīng)急燈、洗眼和噴淋設(shè)施。根據(jù)所配備的生物防護(hù)設(shè)備設(shè)施和個(gè)體防護(hù)能力明確規(guī)定本實(shí)驗(yàn)室所能開(kāi)展的檢驗(yàn)項(xiàng)目。
應(yīng)根據(jù)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估結(jié)果對(duì)檢驗(yàn)人員進(jìn)行生物安全防護(hù)教育,并配備個(gè)人防護(hù)裝備和用品(如手套、口罩、帽子、實(shí)驗(yàn)用鞋、防護(hù)服、防護(hù)眼罩等)。
二級(jí)醫(yī)院不建議保存菌種(質(zhì)控菌株和需要進(jìn)一步確認(rèn)的臨床菌株除外),三級(jí)醫(yī)院可以保存非高致病性病原微生物菌種,但應(yīng)指定專人負(fù)責(zé),應(yīng)有
存儲(chǔ)、使用、轉(zhuǎn)運(yùn)、銷(xiāo)毀記錄,謹(jǐn)防濫用、誤用。實(shí)驗(yàn)中如遇到疑似高致病性菌(按照《人間傳染的病原微生物名錄》),應(yīng)立即向上級(jí)匯報(bào),不要再進(jìn)行后續(xù)的試驗(yàn)和標(biāo)本處理。
對(duì)超過(guò)規(guī)定保存時(shí)間的標(biāo)本和培養(yǎng)物應(yīng)高壓滅菌后再交保潔人員進(jìn)行處理,并進(jìn)行交接記錄。針對(duì)在試驗(yàn)過(guò)程中可能產(chǎn)生的生物安全意外事故(如針刺傷、皮膚、黏膜或環(huán)境污染)應(yīng)有相應(yīng)的應(yīng)急預(yù)案和事故記錄。