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實驗室如何檢測及解決PCR污染的方法

   2017-11-30 現(xiàn)代實驗室裝備網(wǎng)1004
核心提示:面對眾多的污染源,比如樣本交叉污染、試劑儀器交叉污染、克隆質(zhì)粒污染、PCR擴增產(chǎn)物污染、還有極容易忽視的氣溶膠污染,氣溶膠是由固體或液體小質(zhì)點分散并懸浮在氣體介質(zhì)中形成的膠體分散體系,在空氣與液體面摩擦時,比如在操作時比較劇烈地搖動反應管,開蓋時、吸樣時及污染進樣槍的反復吸樣都可形成氣溶膠而污染。

你的實驗結果受到污染的影響了嗎?

生物實驗,大多數(shù)實驗檢測都是微觀的,基于細胞,分子,蛋白水平,而這些微觀樣本對外界環(huán)境的影響敏感,比如溫度、ph值、酶解、損傷等,在我們盡力呵護樣本的生存環(huán)境的同時,污染也是需要注意的頭等大事,要堅決避免環(huán)境中的“雜質(zhì)”的亂入,包括樣本污染,試劑儀器交叉污染、產(chǎn)物氣溶膠污染等對實驗結果的影響。“易查不易察”,污染來的悄無聲息,防不勝防,假陽性結果讓無數(shù)生物學子抓狂和崩潰。

 

小編今天就來扒一扒生物實驗室污染之PCR實驗污染你不知道的事

在眾多的生物實驗室,分子生物學檢測方法如PCR因其高靈敏度、快速、操作方便等優(yōu)勢已經(jīng)被廣泛應用,不過正是由于它靈敏度極高,極微量的污染源都有可能導致檢測結果的假陽性,所以對環(huán)境污染的控制也極為嚴格。面對眾多的污染源,比如樣本交叉污染、試劑儀器交叉污染、克隆質(zhì)粒污染、PCR擴增產(chǎn)物污染、還有極容易忽視的氣溶膠污染,氣溶膠是由固體或液體小質(zhì)點分散并懸浮在氣體介質(zhì)中形成的膠體分散體系,在空氣與液體面摩擦時,比如在操作時比較劇烈地搖動反應管,開蓋時、吸樣時及污染進樣槍的反復吸樣都可形成氣溶膠而污染。據(jù)計算一個氣溶膠顆粒可含48000拷貝,因而由其造成的污染是一個非常重要而被忽視的污染源。

雖然這些污染對PCR實驗結果的影響已經(jīng)受到了廣泛重視,多數(shù)實驗室對污染控制都采取了各種辦法,比如定期大掃除清理、劃分操作區(qū)域、試劑分裝、操作謹慎、重復實驗、多角度驗證結果。但是微量的核酸片段就能被擴增,所以對污染物的控制不僅僅是做到這些就能夠杜絕和避免的,關鍵是需要從源頭控制。目前多數(shù)生物試驗室,分子實驗每天都在大規(guī)模進行,污染源已經(jīng)無處不在,特異性的,非特異性的,同源的,非同源的,廣泛分布在樣本容器、實驗室臺面,試劑溶液中、儀器表面內(nèi)管附著等等,你以為普通的清理就能解決這些污染源嗎?必須是不行的,實驗室大拿們都為了清除這些污染源研究出好多種方法,整理跟大家共享。

 

 
 常見的防止污染的方法,推薦給大家

合理的實驗室分區(qū)

實驗室內(nèi)各工作區(qū)的實驗用品,包括移液器等應專用。如有可能,應在裝有紫外燈的層流式工作臺(如生物安全柜、超凈工作臺)內(nèi),吸加PCR試劑,工作臺內(nèi)應放置PCR專業(yè)用的微量離心機、一次性手套、各量程的移液器和其他必須物品。

 


正確的實驗操作

  1. 吸加PCR試劑和模板的操作應嚴格按要求進行,吸樣要慢,盡量一次性完成,忌多次抽吸,以免交叉污染或產(chǎn)生氣溶膠污染。

  2. 實驗的過程中應勤換手套,在進出不同區(qū)域或進行模板操作后,都應及時更換手套。

  3. 裝有PCR試劑的微量離心管在打開之前應先做瞬時離心(約10s),將管壁及管蓋上的液體甩至管底部,從而減少污染手套或加樣器的機會。開管動作要輕,以防管內(nèi)液體濺出或形成氣溶膠,造成污染。

  4. 在同時進行多個PCR反應時,應制備主反應混合液,再分裝至PCR反應管,最后添加樣品核酸模板,以減少單個添加操作繁瑣造成的污染。

 

實驗器具和試劑

  1. 實驗室自己配置的試劑,如去離子水、緩沖液等,在使用之前均應高壓滅菌或過濾除菌。

  2. 分裝PCR試劑:所有的PCR試劑都應小量分裝,以減少重復取樣次數(shù),并置于-20℃保存,適當時,最好做到專人專用。另外,PCR試劑、PCR反應液應與樣品及PCR產(chǎn)物分開保存,不應放于同一冰盒或冰箱。

  3. 所有吸頭、反應管等應一次性使用,使用之前,都應經(jīng)過高壓處理。若條件允許,最好使用帶濾器的槍頭。各工作區(qū)內(nèi)的移液器要有標識,應固定使用用途,不能交叉使用。

 

實驗設計

實驗設計方面應遵循實驗室內(nèi)部質(zhì)量控制的相關規(guī)定,實驗中至少應:

  1. 設置目標DNA陽性對照反應。對靶序列所作的適當?shù)南♂尮ぷ鲬趯嶒炃霸趯嶒炇覂?nèi)別的位置進行,這樣可防止將靶DNA的濃溶液帶到實驗室中專門進行PCR的位置。

  2. 設置PCR試劑陰性對照和目標DNA陰性對照反應。

 
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