近日,來自瑞士的科學家在國際著名生物學期刊nature medicine發(fā)表了他們的一項最新研究成果,他們結(jié)合壓力循環(huán)技術(shù)(PCT)和SWATH-MS技術(shù)提出一種將臨床組織樣本轉(zhuǎn)換為單個數(shù)字文件的方法,應(yīng)用這種方法對樣本的蛋白組學信息進行記錄,方便研究人員對樣本信息進行反復(fù)分析和對比。這一方法的提出對增加臨床樣本的利用效率具有重要意義。
活體組織檢查(biopsy)簡稱"活檢",是指應(yīng)診斷、治療的需要,從患者體內(nèi)切取、鉗取或穿刺等取出病變組織,進行病理學檢查的技術(shù)。這是診斷病理學中最重要的部分,對絕大多數(shù)送檢病例都能做出明確的組織病理學診斷,被作為臨床的最后診斷?;顧z取出的組織樣本一般量比較少,對于病人疾病的檢測和診斷非常重要。但每一個臨床樣本都具有其唯一性,樣本的量非常有限并且不可再生。類似于組織活檢這樣的小樣本經(jīng)常會在一系列檢驗分析之后被消耗殆盡。
研究人員提出一種結(jié)合壓力循環(huán)技術(shù)(PCT)和SWATH-MS技術(shù)的方法,能夠?qū)⑿×康慕M織樣本轉(zhuǎn)變成單個,永久性的數(shù)字文件,該類文件基于質(zhì)譜技術(shù),記錄著樣本的蛋白組學信息,并具有快速和可重復(fù)性特點。該方法導(dǎo)出的蛋白質(zhì)組學圖譜文件能夠用于不同樣本之間特定蛋白質(zhì)的分析,重分析,對比以進行檢測和量化。
研究人員應(yīng)用這種方法將9名腎細胞癌病人的18個活檢樣本進行了處理并轉(zhuǎn)換成SWATH-MS片段離子圖譜。研究人員從所有樣本的蛋白質(zhì)組學圖譜中檢測并量化了超過2000種蛋白,具有高度重復(fù)性。這些檢測出來的蛋白質(zhì)清晰得將腎臟腫瘤組織與正常的健康組織區(qū)分開來,同時也對各種組織形態(tài)不同的腎臟腫瘤亞型進行了區(qū)分。
綜上所述,該項研究提出了將臨床樣本進行質(zhì)譜處理分析轉(zhuǎn)換成數(shù)字文件的方法,增強了對臨床樣本的利用效率,具有非常重要的意義。