軟硬兼?zhèn)?、高質(zhì)高量的一站式解決方案
21世紀以來,以基因組學為基礎(chǔ)的精準醫(yī)學發(fā)展迅猛,全球各國逐漸啟動萬人級別基因組計劃,百萬級別人口基因組計劃為癌癥、罕見病等臨床應(yīng)用帶來突破口,精準醫(yī)療大數(shù)據(jù)時代加速到來,海量數(shù)據(jù)的產(chǎn)生對匹配的軟硬件設(shè)備、數(shù)據(jù)安全、項目管理等提出了巨大挑戰(zhàn)。
華大智造本次所發(fā)布的百萬級別基因組整體解決方案直面行業(yè)挑戰(zhàn)及需求,依托其獨有的DNBSEQ™ 測序技術(shù)和stLFR長片段建庫技術(shù),細致周全、多次實踐完善的全周期信息管理系統(tǒng),實現(xiàn)從樣本處理到報告出具全流程標準化、高質(zhì)量運作。從硬件上看,整套解決方案包括自動化樣本前處理系統(tǒng)、全自動化建庫系統(tǒng)、日通量可達Tb級別測序儀、每年可處理EB級別的數(shù)據(jù)處理平臺。
全自動化高效運作,Tb級別測序儀全面發(fā)力
自動化樣本處理系統(tǒng)是該解決方案的核心之一,百萬級別基因組測序項目實地運作,測序前樣本處理超大樣本量完全無法依托人工操作完成。
本次華大智造發(fā)布的自動化樣本處理系統(tǒng)主要分為兩部分,第一部分為全血預(yù)處理系統(tǒng),該系統(tǒng)占地空間僅為15㎡,輔助一名操作員即可滿足操作需求。且實現(xiàn)滾動上樣,完全無需人工干預(yù),全年年產(chǎn)量可高達60萬例樣本;第二個重要系統(tǒng)為全自動建庫系統(tǒng),該系統(tǒng)為全球首套超高通量文庫構(gòu)建系統(tǒng)。占地面積大約為100㎡,同時輔助2名操作員即可滿足生產(chǎn)需求;可全天24小時無休運轉(zhuǎn),全程無需人工干預(yù),全年年產(chǎn)量可高達50萬例樣本。
測序設(shè)備方面,此前華大智造超高通量測序儀DNBSEQ-T7從數(shù)據(jù)產(chǎn)量及質(zhì)量已有穩(wěn)定、超預(yù)期表現(xiàn)。在此方案中,華大智造DNBSEQ-T系列測序儀每年測序樣本量可達60萬到80萬人次,為百萬級別基因組項目提供基礎(chǔ)設(shè)備支撐。
全周期信息管理,一站式解決數(shù)據(jù)問題
該方案的另一亮點是包含一站式的數(shù)據(jù)處理平臺,具備一站式、高性能、自動化、低成本、安全等若干優(yōu)點,充分體現(xiàn)“IT+BT”的融合理念,賦能生命科技生態(tài)系統(tǒng)。
大量數(shù)據(jù)測序完成后,數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié)是重中之重,該方案將展示其EB級的容量擴展及數(shù)據(jù)治理、計算及存儲能力,每年能夠完成10萬到100萬樣本量分析;此外,由于數(shù)據(jù)量龐雜,信息流傳遞的過程非常復(fù)雜,該方案融合實驗室管理系統(tǒng)提供端到端的解決方案,易實施部署,全程可追溯、可查詢,解決管理難題;基于基因數(shù)據(jù)安全隱私問題,華大創(chuàng)新的區(qū)塊鏈技術(shù)將提供最大化保障;從成本上看,方案采用存儲分層優(yōu)化管理,并根據(jù)基因數(shù)據(jù)及算法特點,最大化利用存儲資源及計算資源。
基因科技未來突破發(fā)展路徑,邁進“人人基因組”時代
如果將基因科技未來突破發(fā)展路徑生動類比為一把剪刀,剪刀的一邊代表測序成本的下降,另外一邊代表測序通量的提升,一升一降所形成的“大剪刀”,代表著基因科技未來突破發(fā)展的路徑。要使得生命時代的“剪刀差”來得更快,基因測序成本降低和全基因組檢測覆蓋度是兩個重要因素。
在樣本量超大的前提下,從收到樣本到出具報告,每一個環(huán)節(jié)的問題都可能影響最終結(jié)果。只有標準化、信息化的運作,盡量減少人工干預(yù),提升自動化程度,才能最大程度保證大項目高效、優(yōu)質(zhì)完成,進一步為臨床應(yīng)用提供高精度、可靠的基因組數(shù)據(jù)信息。
華大智造百萬基因組整體解決方案在整合自身軟硬件資源前提下,拓展技術(shù)邊界,為大人群基因組項目提供了一套切實可行、優(yōu)質(zhì)完備的整體解決方案,加速邁進“人人基因組”時代步伐。