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NIH出資$3.13億用于疾病基因組測序研究

   2025-05-02 測序中國440
美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)將資助一些基因組測序分析中心,致力于破解人類常見病和罕見病的基因信息。NIH下屬的國家人類基因組研究所(NHGRI)14日宣布成立“常見疾病基因組學(xué)中心(CCDG)”,該中心將利用基因組測序技術(shù),從基因水平研究心臟病、糖尿病、中風(fēng)以及自閉癥等常見疾病產(chǎn)生的原因。NHGRI同時也宣布了其互補項目“孟德爾基因組學(xué)中心(CMG)”的下一階段工作,將繼續(xù)研究罕見遺傳疾病(例如囊性纖維化和肌肉萎縮癥)的基因致病機制。

  NHGRI所長Green博士表示:“DNA測序的發(fā)展可幫助我們進一步探索人類疾病產(chǎn)生過程中基因是如何發(fā)揮作用的。我們將持續(xù)關(guān)注常見疾病和罕見疾病,希望能夠揭示一些重要的基因信息。”

  CCDG的研究人員計劃先對一組疾病、15萬~20萬個患者進行基因組測序,在基因組水平研究常見疾病產(chǎn)生的原因,及基因組的差異是如何影響患病風(fēng)險的,同時也將開發(fā)出一套研究模型用于今后常見疾病的研究。CMG研究者將建立一個國際研究合作網(wǎng)絡(luò),對世界范圍內(nèi)存在的罕見疾病進行基因組測序。這兩個項目通過研究引發(fā)疾病的基因以及基因組變異,有助于對疾病的診斷和潛在治療。

  NHGRI將在未來四年內(nèi)分別資助CCDG和CMG項目2.4億美元和4千萬美元,同時出資約400萬美元資助一個新的協(xié)調(diào)中心,促進這些項目者之間的合作、數(shù)據(jù)的分析和項目的推廣。

  除此之外,美國國家心臟、肺和血液學(xué)研究所(NHLBI)將同時資助CCDG和CMG項目,美國國家眼科研究所(NEI)將為CMG項目提供資助,這兩個機構(gòu)同屬于NIH。

  CCDG項目的開展代表著NHGRI的基因組測序計劃(GSP)又向前邁出了一大步。最早期階段,GSP是NIH對人類基因組計劃的重要貢獻。隨著DNA測序成本的降低,GSP開始將重心轉(zhuǎn)移到大規(guī)?;蚪M測序項目上,并組織成立 了“大規(guī)?;蚪M測序和分析中心”。這些測序中心進行了一系列開創(chuàng)性的基因組學(xué)研究,包括千人基因組計劃,對世界各地不同人群中數(shù)千人進行基因組測序,記錄不同個體的基因組差異性;和癌癥基因組圖譜(TCGA)計劃,由NHGRI和美國國家癌癥研究所合作,記錄癌癥相關(guān)的基因組變異信息。

  常見疾病基因組學(xué)中心(CCDG)

  高血壓、糖尿病以及精神疾病等常見疾病影響世界范圍內(nèi)數(shù)億的人群,然而到目前為止我們都無法解釋這些疾病產(chǎn)生的根源,因為它們的發(fā)生往往源自基因和環(huán)境因素的雙重作用。

  CCGD研究人員將首先關(guān)注心血管/代謝疾病以及神經(jīng)精神性疾病,同時考慮研究其他疾病包括炎癥/自身免疫病、骨骼疾病,阿茲海默癥等。每一種常見疾病都代表著一系列的健康問題,從發(fā)病年齡到潛在的生物學(xué)改變都各不相同。對于每一種疾病,CCDG研究人員都將對數(shù)萬個患者及正常對照人群進行基因組測序,NHGRI也將挑選一些其他疾病用于該中心后續(xù)的研究。

  NHGRI基因組測序計劃負(fù)責(zé)人Felsenfeld博士說:“該中心的研究人員計劃利用基因測序,盡可能廣泛地檢測出與常見疾病相關(guān)的基因和基因組變異。這些基因信息將在我們的臨床管理中起到非常大的作用。”

  NHGRI將在未來四年中為四個中心提供約2.4億美金,NHLBI則額外提供2000萬美金,具體資助情況如下:

  1. 圣路易斯華盛頓大學(xué);6000萬美元,4年

  主要研究人員:Richard Wilson, Ph.D.

  2. 麻省理工學(xué)院-哈佛大學(xué)博德研究所;8000萬美元,4年

  主要研究人員:Eric Lander, Ph.D., Mark Daly, Ph.D., Stacey Gabriel, Ph.D.和Sekar Kathiresan, M.D.

  3. 休斯頓貝勒醫(yī)學(xué)院;6000萬美元,4年

  主要研究人員:Richard Gibbs, Ph.D.

  4. 紐約基因組中心;4000萬美元,4年

  主要研究人員:Robert Darnell, M.D., Ph.D.

  孟德爾基因組學(xué)中心(CMG)

  NHGRI自2011年啟動了CMG計劃,總體目標(biāo)是從基因組學(xué)角度系統(tǒng)地分析孟德爾遺傳病產(chǎn)生的原因,這類疾病通常是由單基因突變引發(fā)的罕見疾病。到目前為止,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了7400多種孟德爾疾病,并闡明了其中4300種疾病的潛在致病基因變異信息。

  在過去的四年中,CMG研究人員對超過2萬個人的蛋白編碼區(qū)進行測序分析,發(fā)現(xiàn)超過740種致病基因,同時開發(fā)出一種分析工具可快速查找這些致病基因。

  CMG計劃負(fù)責(zé)人Wang博士介紹說:“罕見疾病為我們進行罕見和常見疾病的生物學(xué)研究提供了重要資源。CMG研究人員將繼續(xù)利用基因測序和分析尋找孟德爾疾病產(chǎn)生的致病基因,尤其是發(fā)現(xiàn)新的致病基因。”

  NHGRI將資助4000萬美元支持CMG計劃,同時NHLBI和NEL也將分別資助800萬美元和100萬美元用于該計劃實施。具體資助情況如下:

  1. 麻省理工學(xué)院-哈佛大學(xué)博德研究所;1340萬美元,4年

  主要研究人員:Daniel MacArthur, Ph.D.和Heidi Rehm, Ph.D.

  2. 耶魯大學(xué);1200萬美元,4年

  主要研究人員:Richard Lifton, M.D., Ph.D., Murat Gunel, M.D., Shrikant Mane, Ph.D.和MarkGerstein, Ph.D.

  3. 西雅圖華盛頓大學(xué)和休斯頓貝勒醫(yī)學(xué)院,1200萬美元,4年

  主要研究人員:Deborah Nickerson, Ph.D. (華盛頓大學(xué)), Michael Bamshad, M.D. (華盛頓大學(xué)) and Suzanne Leal, Ph.D. (貝勒醫(yī)學(xué)院)

  4. 約翰霍普金斯大學(xué)和貝勒醫(yī)學(xué)院,1160萬美元,4年

  主要研究人員:David Valle, M.D. (約翰霍普金斯大學(xué)) 和 JamesLupski, M.D., Ph.D. (貝勒醫(yī)學(xué)院)

  GSP協(xié)調(diào)中心

  GSP協(xié)調(diào)中心將促進項目者間的合作并進行項目推廣活動,提升測序數(shù)據(jù)的利用率,并引導(dǎo)進行各種不同的數(shù)據(jù)分析工作。

  NHGRI將提供以下資助:

  1. 美國羅格斯大學(xué);400萬,4年;

  主要人員:Tara Matise, Ph.D.和Steven Buyske, Ph.D.


 

 
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