查找食源性病原微生物基因
食源性疾病是食品安全的主要問題，世界衛(wèi)生組織將食源性疾病定義為：凡是通過攝食進(jìn)入人體的，引發(fā)人體罹患感染性或中毒性的疾病，其中包括由食品微生物污染和化學(xué)性物質(zhì)引起的食源性疾病，微生物引起的食源性疾病是食品安全的主要問題。
“十萬食源性病原微生物基因組計劃”是由美國食品藥品監(jiān)督局(FDA)支持，美國國家衛(wèi)生院、農(nóng)業(yè)部、國家疾控中心和歐盟等國家參與，加州大學(xué)戴維斯分校牽頭的一個國際基因組項目，其目標(biāo)是通過大規(guī)模病原基因組研究，獲得新方法新技術(shù)，以保證對食品安全問題提供解決方案。此項目是一個里程碑式的大規(guī)模研究，于2013年初啟動，旨在創(chuàng)建一個包含大多數(shù)食源性致病菌基因組的公共數(shù)據(jù)庫。
“十萬食源性病原微生物基因組計劃”負(fù)責(zé)人、美國加州大學(xué)戴維斯分校(UC Davis)教授Bart Weimer教授在北京接受科技日報記者采訪時表示，“我們正在創(chuàng)建一個免費(fèi)的、在線的基因組百科全書或參考數(shù)據(jù)庫，以確保在食源性疾病暴發(fā)時，科學(xué)家和公共衛(wèi)生專家可以很快確定致病微生物的種類，并且使用自動化信息處理方法追蹤到其在食物供應(yīng)中的源頭。”
中美雙方將開展多項合作
隨著食品供應(yīng)成為一個全球性的產(chǎn)業(yè)，食品安全已成為全球的責(zé)任，Bart Weimer教授希望通過全球的合作，為國際公共健康管理帶來一種新的模式。他說，該項計劃還將徹底改變農(nóng)業(yè)檢測中現(xiàn)行的一些方法，以提高對食物鏈各環(huán)節(jié)(從農(nóng)場到餐桌)分子檢測的精確性和穩(wěn)定性。
在中國，對于食源性致病菌的基因研究還剛剛開始，北京諾塞基因組研究中心有限公司曾參與2003年全人類基因組測序項目，并一直關(guān)注著基因檢測領(lǐng)域的研究和發(fā)展趨勢。此次由該中心牽頭，聯(lián)手中國科學(xué)院微生物研究所病原微生物與免疫重點(diǎn)實驗室和北京師范大學(xué)生命科學(xué)研究院基因資源與分子發(fā)育北京市重點(diǎn)實驗室三方形成中國科學(xué)家團(tuán)隊，與美國加州大學(xué)戴維斯分校Bart Weimer博士實驗室開展合作研究，將在全球食源性致病菌基因研究中扮演積極的角色，為數(shù)據(jù)共享、市場開發(fā)和技術(shù)應(yīng)用提供有效的應(yīng)用平臺。
記者了解到，在“十萬食源性病原微生物基因組計劃”簽約項目中，中美雙方的合作包括以下七大方面：一是中美專家在科學(xué)和技術(shù)人員之間培訓(xùn)和交流;二是“十萬病原基因組項目”的基因組測序技術(shù)在亞洲范圍內(nèi)的擴(kuò)大合作;三是生物資源的交換;四是項目相關(guān)信息和生物信息學(xué)的交換;五是聯(lián)合發(fā)表科學(xué)出版物;六是爭取兩國對此合作項目聯(lián)合資助。
中國將建立綜合性基因數(shù)據(jù)庫
中美合作開展“十萬食源性病原微生物基因組計劃”，對于諾賽基因組研究中心的發(fā)展是一次新的機(jī)遇。北京諾賽基因組研究中心總經(jīng)理李秉珅表示，諾賽基因組研究中心最初是為了完成人類基因組計劃而建立的，但是隨著人類基因組計劃的完成，諾賽研究中心的發(fā)展亟須新活力的注入，實現(xiàn)體制上的改革與轉(zhuǎn)變?！按舜螄H合作的開展對于諾賽的未來發(fā)展意義深遠(yuǎn)，諾賽將再前期投入500萬元用于平臺建設(shè)和研發(fā)需要，我們也期待著政府能夠給予項目更多的支持”，李秉坤強(qiáng)調(diào)。
在本次合作中，中國科學(xué)院微生物所的主要職責(zé)是進(jìn)行食源性病原微生物的基因測序與收集工作，同時，以高通量測序技術(shù)建立和完善生物信息分析平臺。中國科學(xué)院微生物研究所病原微生物與免疫重點(diǎn)實驗室負(fù)責(zé)人朱寶利教授稱,他們將實現(xiàn)對大樣本食源性病毒基因的總監(jiān)控，對外公布基因測序相關(guān)數(shù)據(jù)，并且建立綜合性基因數(shù)據(jù)庫。
北京師范大學(xué)生命科學(xué)研究院王英典院長告訴記者，病源性病菌基因數(shù)據(jù)庫的建立對于國家食品安全問題的解決具有重大戰(zhàn)略意義。當(dāng)前，中國市場上食品并未進(jìn)行食源性病源微生物檢測，因此，與美國合作建立病源性基因組數(shù)據(jù)庫，將為糧食安全、食品安全以及環(huán)境安全問題提供更加有效便捷廉價的解決方案。北京師范大學(xué)將利用“基因資源與分子發(fā)育北京市重點(diǎn)實驗室”，與諾賽基因組研究中心和中科院微生物所共同建立技術(shù)平臺和功能實驗室。
作為北京市生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要平臺，北京生物技術(shù)和新醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)促進(jìn)中心一直承擔(dān)著引領(lǐng)技術(shù)創(chuàng)新，促進(jìn)國際交流和成果轉(zhuǎn)化的作用，該中心主任雷霆在闡述此次國際合作的意義時指出，中美雙方在國際化平臺上，將打破原有的研發(fā)合作模式，遵循各項法律法規(guī)，強(qiáng)調(diào)生物材料如微生物分離株、DNA序列及微生物綜合數(shù)字的轉(zhuǎn)移和共享，同時，對于知識產(chǎn)權(quán)將做出合理的界定，為推動基因組測序技術(shù)推廣、學(xué)術(shù)交流和人員培訓(xùn)開展更多合作。
北京市科委主任閆傲霜對于“十萬食源性病原微生物基因組計劃”的國際合作平臺的建立給予了積極肯定。她表示，目前的食品安全、土地環(huán)境污染以及農(nóng)業(yè)技術(shù)的可持續(xù)發(fā)展都面臨著嚴(yán)峻的形勢，而基因技術(shù)將為上述領(lǐng)域帶來跨越式飛躍，盡管現(xiàn)在應(yīng)用還不很明朗，但是，未來技術(shù)產(chǎn)業(yè)化和市場空間前景不可預(yù)期。她說，“北京生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展非常強(qiáng)調(diào)國際合作，此次與美國加州大學(xué)戴維斯分校Bart Weimer博士建立合作，將在創(chuàng)新技術(shù)、人才培養(yǎng)、信息資源共享以及企業(yè)成果轉(zhuǎn)化上開辟出新的模式。
據(jù)了解，中美雙方關(guān)于“十萬食源性病原微生物基因組計劃”已正式簽訂合作備忘錄，并制定了合作框架，有望于今年下半年正式開始基因測序樣本的研發(fā)和數(shù)據(jù)庫建立。
