美國梅奧診所是一所擁有悠久歷史的綜合醫(yī)學(xué)中心，在美國擁有多家診所、自己的醫(yī)學(xué)院以及數(shù)千名臨床專家和科學(xué)家。最近美國梅奧診所在其醫(yī)學(xué)期刊中發(fā)表了一篇文獻(xiàn)1，介紹正在進(jìn)行的一個(gè)以藥物基因信息指導(dǎo)個(gè)性用藥的項(xiàng)目，該項(xiàng)目也是美國國家健康研究所(NIH)支持的一個(gè)個(gè)性化用藥研究項(xiàng)目(The Right Drug, Right Dose, Right Time-Using Genomic Data to Individualize Treatment Protocol) 的組成部分之一。
在這個(gè)項(xiàng)目中，梅奧診所的科研人員首先通過統(tǒng)計(jì)學(xué)模型，根據(jù)年齡、性別、種族和6種慢性病記錄，從病人數(shù)據(jù)庫中選出了在三年內(nèi)有較高可能性會(huì)接受斯達(dá)汀類藥物進(jìn)行治療的病人，向這些病人發(fā)出邀請(qǐng)。邀請(qǐng)他們自愿參與一組藥物基因的變異檢測，檢測結(jié)果將記錄在他們的電子醫(yī)療檔案中，這些基因變異檢測的結(jié)果可以用于一些藥物使用的參考。
藥物研究已結(jié)果表明，一些基因變異可以使得不同個(gè)體對(duì)于藥物產(chǎn)生不同反應(yīng)。相同的藥物，可能在不同的個(gè)體中引起包括嚴(yán)重副作用、正常作用、完全無效等不同的用藥結(jié)果，其原因之一在于個(gè)體的某些基因基因型的差異。因而，在床旁診斷中包括藥物基因檢測結(jié)果，對(duì)于減小副作用、最大化藥效、合理選擇藥物，非常重要。而目前這一實(shí)踐受到限制的原因在于傳統(tǒng)藥物基因組檢測，一般僅在用藥前進(jìn)行基因檢測影響用藥的及時(shí)性、延誤治療時(shí)機(jī)；而普通電子醫(yī)療記錄尚未能包含藥物基因檢測結(jié)果、基因與用藥關(guān)系的信息，也影響了個(gè)性化治療的開展；另外，對(duì)于根據(jù)藥物基因組檢測結(jié)果指導(dǎo)用藥是否能提高經(jīng)濟(jì)效益及臨床結(jié)果也尚缺乏大樣本數(shù)據(jù)支持。
表：由the Pharmacogenomics Research Network挑選的利用NimbleGen序列捕獲后測序的84個(gè)藥物基因列表。摘自Bielinski SJ, et al.Mayo Clin Proc. 2014 Jan;89(1):25-33. doi: 10.1016/j.mayocp.2013.10.021.
此次梅奧診所的項(xiàng)目完成了1000名病人，共85個(gè)藥物基因變異的檢測，并將這些變異根據(jù)現(xiàn)有的基因與藥效數(shù)據(jù)生成臨床用藥指導(dǎo)信息，記錄在病人的醫(yī)療電子檔案中。這些病人在此后一旦需要進(jìn)行相關(guān)藥物治療，就可以直接參考這些數(shù)據(jù)選擇合適藥物和劑量。在基因突變檢測中，除CYP2D6基因外，其他藥物基因變異檢測主要方法是通過定向二代測序方法完成的：首先采集病人血樣、提取基因組DNA，再用羅氏NimbleGen序列捕獲探針富集樣本中84個(gè)藥物基因的DNA片段，而后進(jìn)行二代測序。這一方法，可以幫助同步完成數(shù)十病人、大量基因的同步測序，時(shí)間成本及檢測費(fèi)用都相對(duì)較少。此次挑選進(jìn)行捕獲測序的基因包括84個(gè)已知與用藥相關(guān)的基因，由美國藥物基因組研究網(wǎng)絡(luò)（the Pharmacogenomics Research Network）開發(fā)，檢測結(jié)果分別用于臨床相關(guān)的用藥指導(dǎo)和研究用途?；驕y序結(jié)果進(jìn)行分析后，根據(jù)現(xiàn)有的基因與藥物關(guān)系信息生成用藥指導(dǎo)信息，保存在電子檔案中。值得一提的事，其他的測序結(jié)果也被保留下來，如在將來獲得新的基因變異與用藥關(guān)系的證據(jù)，可以重新對(duì)基因結(jié)果再次進(jìn)行分析，并將新的用藥指導(dǎo)信息添加到電子檔案之中。
研究者認(rèn)為這個(gè)項(xiàng)目的意義可用于評(píng)估提前進(jìn)行藥物基因檢測及利用電子醫(yī)療檔案中基因信息指導(dǎo)用藥的作用，可能創(chuàng)新出新的利用基因檢測結(jié)果指導(dǎo)用藥的方法。
1. Bielinski SJ, et al.Preemptive Genotyping for Personalized Medicine: Design of the Right Drug, Right Dose, Right Timed Using Genomic Data to Individualize Treatment Protocol. Mayo Clin Proc. 2014 Jan;89(1):25-33. doi: 10.1016/j.mayocp.2013.10.021.
僅用于生命科學(xué)研究，不用于診斷
