傳統(tǒng)上,基于不同的細(xì)菌或真菌內(nèi)蛋白組成分特別是核糖體蛋白有顯著的差異,對(duì)核糖體蛋白組的質(zhì)譜測(cè)試,可用于快速、高準(zhǔn)確度鑒定微生物?;|(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS,)亦因此應(yīng)用,廣泛應(yīng)用于歐美等發(fā)達(dá)國(guó)家以及我國(guó)的三甲醫(yī)院、省市級(jí)食品安全監(jiān)管機(jī)構(gòu)等。結(jié)合了該方法的質(zhì)譜在業(yè)內(nèi)一般被稱為“微生物質(zhì)譜”。限于傳統(tǒng)MALDI-TOF MS的性能局限,該方法未能利用更豐富的生物信息。
超4000種,生物組學(xué)微生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)
微生物質(zhì)譜可實(shí)現(xiàn)對(duì)已知微生物的鑒定,其鑒定核心之一為微生物數(shù)據(jù)庫(kù)容量。傳統(tǒng)的微生物數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)方式為使用質(zhì)譜儀采集經(jīng)過(guò)形態(tài)學(xué)或基因組學(xué)確認(rèn)的已知微生物核糖體蛋白特征峰信息,并形成數(shù)據(jù)庫(kù)。該方法效率低、成本高,準(zhǔn)確性難以保障。也因此,雖然地球上的微生物種類多達(dá)百萬(wàn)種以上,但目前可用于微生物質(zhì)譜鑒定的微生物只有數(shù)千種。
擁有先進(jìn)科學(xué)儀器和生命科學(xué)背景的融智生物創(chuàng)新性地利用了新的微生物數(shù)據(jù)庫(kù)理念,改變了傳統(tǒng)的建庫(kù)流程,近期完成了QuanID微生物數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)。通過(guò)生物組學(xué)信息的結(jié)合,在獨(dú)特?cái)?shù)據(jù)算法支持下,高效率地建設(shè)質(zhì)譜鑒定微生物數(shù)據(jù)庫(kù)。截至目前,QuanID微生物數(shù)據(jù)庫(kù)已建成包含超過(guò)4000種微生物(細(xì)菌、真菌),涵蓋臨床、食品安全、畜牧獸醫(yī)、環(huán)境生態(tài)和科研等多個(gè)領(lǐng)域的巨大微生物質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫(kù)。經(jīng)過(guò)臨床、疾控、食品安全、水產(chǎn)畜牧等多行業(yè)近萬(wàn)個(gè)樣本的實(shí)際驗(yàn)證,(種、亞種級(jí))準(zhǔn)確率高達(dá)95%以上。融智生物認(rèn)為,基于生物組學(xué)的QuanID微生物數(shù)據(jù)庫(kù)代表了新一代質(zhì)譜微生物數(shù)據(jù)庫(kù)的發(fā)展方向,將取代傳統(tǒng)的建庫(kù)方式。
在全新建庫(kù)方式之外,融智生物還與多家國(guó)內(nèi)知名菌種保藏單位合作,不斷完善本地特有微生物數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè),使得該微生物數(shù)據(jù)庫(kù)不僅可勝任國(guó)際通用微生物鑒定,同時(shí),更適合國(guó)內(nèi)用戶需求。未來(lái),融智生物還將進(jìn)一步快速擴(kuò)展微生物數(shù)據(jù)庫(kù)容量,使微生物質(zhì)譜可適用于更廣泛的行業(yè)。
QuanID微生物鑒定質(zhì)譜系統(tǒng)
2017年,融智生物宣布推出新一代寬譜定量飛行時(shí)間質(zhì)譜QuanTOF,基于該質(zhì)譜平臺(tái),融智生物開(kāi)發(fā)了包括糖化血紅蛋白定量檢測(cè)系統(tǒng)、QuanID微生物鑒定質(zhì)譜系統(tǒng)、SNP基因分型質(zhì)譜系統(tǒng)、豬肉品質(zhì)鑒定系統(tǒng)等多個(gè)應(yīng)用產(chǎn)品。該平臺(tái)于2018年4月被由兩院院士等專家組成的專家委員會(huì)評(píng)定為“整體性能達(dá)到世界先進(jìn)水平”。