近日, 中科院昆明動(dòng)物研究所研究員馬占山與美國(guó)馬里蘭大學(xué)葉承曦博士在基因測(cè)序領(lǐng)域的合作取得重要突破,合作團(tuán)隊(duì)近日正式發(fā)布了一款代號(hào)為 Sparc 的軟件。 針對(duì)第三代基因測(cè)序儀硬件錯(cuò)誤率高達(dá) 15%-40%的現(xiàn)實(shí),采用新算法設(shè)計(jì)的 Sparc 軟件所取得的結(jié)果錯(cuò)誤率低于 0.5%,同時(shí)還可節(jié)省測(cè)序時(shí)間和內(nèi)存達(dá) 80%。
主要觀點(diǎn)
三代測(cè)序準(zhǔn)確率低的難題有望解決
從 1975 年 Sanger 和 Coulson 發(fā)明了第一代基因測(cè)序技術(shù)——雙脫氧終止法,到現(xiàn)在,基因測(cè)序已經(jīng)經(jīng)歷了三代技術(shù)革命。 第三代測(cè)序技術(shù)是指單分子測(cè)序技術(shù), 測(cè)序時(shí)主要利用熒光測(cè)序、納米孔測(cè)序等手段, 不需要經(jīng)過 PCR 擴(kuò)增,實(shí)現(xiàn)了對(duì)每一個(gè) DNA 分子的單獨(dú)測(cè)序,具有測(cè)序速度快、測(cè)序序列長(zhǎng)等優(yōu)勢(shì),但第三代測(cè)序技術(shù)也存在一個(gè)重大的技術(shù)瓶頸,就是測(cè)序準(zhǔn)確度的問題,大大限制了其商業(yè)化的應(yīng)用。此次,中美科研團(tuán)隊(duì)的發(fā)明有望解決第三代測(cè)序準(zhǔn)確率低的技術(shù)難題, 從而推進(jìn)基因測(cè)序技術(shù)邁向三代技術(shù)的產(chǎn)業(yè)升級(jí)。但是,短期內(nèi),市場(chǎng)仍將以二代高通量測(cè)序技術(shù)為主導(dǎo)。
精準(zhǔn)醫(yī)療板塊值得長(zhǎng)期關(guān)注
受消息面的影響,基因測(cè)序板塊今日大漲,截至上午收盤,基因測(cè)序板塊上漲 3.61%,達(dá)安基因、新開源、安科生物、北陸藥業(yè)等個(gè)股漲停?;驕y(cè)序是整個(gè)精準(zhǔn)醫(yī)療的基礎(chǔ),同時(shí)也是整個(gè)精準(zhǔn)醫(yī)療內(nèi)發(fā)展得相對(duì)比較成熟的領(lǐng)域,在疾病的預(yù)防、篩查、 診斷及個(gè)體化治療等方面均有較好的應(yīng)用前景。國(guó)內(nèi)政策從最初的喊停,到現(xiàn)在通過逐步開放試點(diǎn)、加強(qiáng)監(jiān)管的方式引導(dǎo)行業(yè)健康有序地發(fā)展,政策的回暖也為基因測(cè)序乃至整個(gè)精準(zhǔn)醫(yī)療的快速發(fā)展提供了保障。