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冷凍電鏡助力施一公發(fā)表諾獎級別研究成果

   2025-03-23 清華大學微信公眾號5837
      8月21日,清華大學生命科學學院施一公教授研究組在《科學》周刊(Science)同時在線發(fā)表了兩篇背靠背研究長文,題目分別為“3.6埃的酵母剪接體結構”(Structure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom Resolution)和“前體信使RNA剪接的結構基礎”(Structural Basis of Pre-mRNA Splicing)。

  第一篇文章報道了通過單顆粒冷凍電子顯微技術(冷凍電鏡)解析的酵母剪接體近原子分辨率的三維結構,第二篇文章在此結構的基礎上進行了詳細分析,闡述了剪接體對前體信使RNA執(zhí)行剪接的基本工作機理。清華大學生命學院閆創(chuàng)業(yè)博士、醫(yī)學院博士研究生杭婧和萬蕊雪為兩篇文章的共同第一作者。

  這一研究成果具有極為重大的意義。自1993年RNA剪接的發(fā)現(xiàn)以來,科學家們一直在步履維艱地探索其中的分子奧秘,期待早日揭示這個復雜過程的分子機理。施一公院士研究組對剪接體近原子分辨率結構的解析,不僅初步解答了這一基礎生命科學領域長期以來備受關注的核心問題,又為進一步揭示與剪接體相關疾病的發(fā)病機理提供了結構基礎和理論指導。

  清華大學將于近期召開新聞發(fā)布會,介紹這項重大的科研成果。

  另據(jù)《賽先生》對施一公的一篇專訪介紹,“這項研究成果的意義很可能超過了我過去25年科研生涯中所有研究成果的總和!”施一公振奮地表示:“我此前以通訊作者身份在《科學》、《自然》和《細胞》上發(fā)表的文章總共接近50篇,但我覺得這次的意義特別重大!”

  6月24日,Nagai研究組的一篇論文于《自然》網(wǎng)站在線發(fā)表,其工作將剪接體所涉及的一個中心復合物tri-snRNP的分辨率提高到了5.9個埃米,一度引起轟動。而此前人類對基因剪接體的認識精度只有29個埃米。1埃米為10-10米,即把1米分成十億份,其之微小可以想見,因此Nagai的最新工作被稱為近原子尺度的結構研究。

  而施一公團隊此次得到的結果不僅將精度由5.9個埃米提高到了3.6個埃米,而且其解析對象是真正的剪接體,而不是Nagai團隊所取得的參與剪接體組裝過程的復合物,從而第一次在近原子分辨率上看到了剪接體的細節(jié)。

  對于施一公團隊的最新成果,很多同行給出了非常高的評價:將受諾獎考慮。

  一直以來,研究蛋白質(zhì)結構有三種主要方法:X射線晶體衍射、核磁共振以及單顆粒冷凍電子顯微鏡(冷凍電鏡)。而施一公所采用的冷凍電鏡技術在過去兩年里取得了革命性的進展,一方面是它的照相機技術,一方面是其軟件分析的圖像處理技術,尤其是前者的進步大幅提高了冷凍電鏡的解析能力。

  施一公說:“如果沒有冷凍電鏡技術,就完全不可能得到剪接體近原子水平的分辨率。”

  尤為幸運的是,早在冷凍電鏡技術還遠未成勢的2007年,清華大學就在上述三種方法中選擇了重點發(fā)展冷凍電鏡技術,如今清華擁有世界最大的冷凍電鏡系統(tǒng)。施一公把他和同事們當年卓有遠見的選擇歸于“幸運”,他說“如果沒有冷凍電鏡肯定做不到今天的結果,而當年確實沒想到冷凍電鏡會出現(xiàn)飛躍性的進展。”

  “幸運”遠不止是當年選對了技術。除了儀器的進步,在施一公看來,他們能領先競爭對手的主要原因是擁有極為成熟的樣品處理方法。“也就是說如何讓蛋白質(zhì)服服帖帖、性質(zhì)穩(wěn)定,成為適合結構解析的樣品”,他半開玩笑地說“這是我們的獨門絕招,這個絕招即便寫出來,別人不在我的實驗室做上一兩年也很難理解或吃透,因為這是師傅帶徒弟一點點積累起來的。”

  除了靠譜的儀器、技術和學生,施一公說,“膽量”給了他們最大的驚喜。“本來我們的樣品不是最理想的狀態(tài),學生有點不敢試,我說不妨上一下試試,最多就是不成功,只要有15埃的分辨率就很好了,結果算出來竟然有3.6埃。我們在今年整個4月份里做計算,那一個月突破連連、都跟做夢似的!”

 

 
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