NimbleDesign是羅氏NimbleGen推出的免費(fèi)在線軟件,用于NimbleGenSeqCap EZ Choice以及Choice XL人類基因組目標(biāo)區(qū)域的定向捕獲探針設(shè)計(jì)。現(xiàn)在您只需用一分鐘注冊(cè)您的賬戶,就可以享受到NimbleGen專有的探針?biāo)惴ㄋ鶐淼母呙芏?、高覆蓋、高效率的探針設(shè)計(jì),從而開始您感興趣的目標(biāo)區(qū)域定向富集,以及后續(xù)更多的二代測(cè)序應(yīng)用。
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NimbleGenSeqCap EZ Library系列序列捕獲產(chǎn)品的探針設(shè)計(jì)擁有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),以每次捕獲設(shè)計(jì)擁有多達(dá)200萬個(gè)探針、探針采用在目標(biāo)區(qū)域的高密度疊式排布而著稱,保證了在捕獲過程中對(duì)于包括片段插入缺失等各種類型突變的有效捕獲。這些特點(diǎn)不僅來自于來自于探針設(shè)計(jì)時(shí)所采用的算法。NimbleGen建立了特殊的探針設(shè)計(jì)算法,使得NimbleGen的高密度探針生產(chǎn)工藝可以更好地應(yīng)用到序列捕獲之中。而且NimbleGen優(yōu)化了repeat mask算法,使得目標(biāo)區(qū)域中的更多堿基序列可以直接設(shè)計(jì)探針,從而保證了目標(biāo)區(qū)域的更高覆蓋。

NimbleGen自有算法可以更好的針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行探針設(shè)計(jì)。例如上圖中對(duì)11號(hào)染色體上一個(gè)500kb的區(qū)域進(jìn)行探針設(shè)計(jì),黑色區(qū)域分別表示由兩種不同算法計(jì)算出的探針?biāo)芨采w的區(qū)域,而紅色區(qū)域表示只有NimbleGen的設(shè)計(jì)能覆蓋的區(qū)域。

NimbleDesign軟件設(shè)計(jì)流程
● 縮短定制設(shè)計(jì)時(shí)間
● 易學(xué)易用在線軟件
● 在軟件中隨時(shí)可以獲取各種幫助信息
● 將專業(yè)的捕獲設(shè)計(jì)算法帶到您的身邊