NimbleDesign是羅氏NimbleGen推出的免費(fèi)在線軟件，用于NimbleGenSeqCap EZ Choice以及Choice XL人類基因組目標(biāo)區(qū)域的定向捕獲探針設(shè)計(jì)。現(xiàn)在您只需用一分鐘注冊(cè)您的賬戶，就可以享受到NimbleGen專有的探針?biāo)惴ㄋ鶐淼母呙芏?、高覆蓋、高效率的探針設(shè)計(jì)，從而開始您感興趣的目標(biāo)區(qū)域定向富集，以及后續(xù)更多的二代測(cè)序應(yīng)用。
從www.nimblegen.com（左圖）即可進(jìn)入NimbleDesign頁面，或者直接進(jìn)入design.nimblegen.com（右圖），注冊(cè)時(shí)需選擇China區(qū)域。
NimbleGenSeqCap EZ Library系列序列捕獲產(chǎn)品的探針設(shè)計(jì)擁有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)，以每次捕獲設(shè)計(jì)擁有多達(dá)200萬個(gè)探針、探針采用在目標(biāo)區(qū)域的高密度疊式排布而著稱，保證了在捕獲過程中對(duì)于包括片段插入缺失等各種類型突變的有效捕獲。這些特點(diǎn)不僅來自于來自于探針設(shè)計(jì)時(shí)所采用的算法。NimbleGen建立了特殊的探針設(shè)計(jì)算法，使得NimbleGen的高密度探針生產(chǎn)工藝可以更好地應(yīng)用到序列捕獲之中。而且NimbleGen優(yōu)化了repeat mask算法，使得目標(biāo)區(qū)域中的更多堿基序列可以直接設(shè)計(jì)探針，從而保證了目標(biāo)區(qū)域的更高覆蓋。
NimbleGen自有算法可以更好的針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行探針設(shè)計(jì)。例如上圖中對(duì)11號(hào)染色體上一個(gè)500kb的區(qū)域進(jìn)行探針設(shè)計(jì)，黑色區(qū)域分別表示由兩種不同算法計(jì)算出的探針?biāo)芨采w的區(qū)域，而紅色區(qū)域表示只有NimbleGen的設(shè)計(jì)能覆蓋的區(qū)域。
而NimbleDesign將NimbleGen探針?biāo)惴◣У侥纳磉?，是NimbleGenBioinformatics團(tuán)隊(duì)心血之作，從此您可以全天候、全時(shí)段、零距離地使用NimbleGen專有的探針?biāo)惴āＯ聢D顯示了NimbleDesign的設(shè)計(jì)流程，提交設(shè)計(jì)背景信息、目標(biāo)區(qū)域范圍以及選擇探針設(shè)計(jì)參數(shù)后，即可在最快幾分鐘到最多24小時(shí)，獲得您的探針設(shè)計(jì)文件。當(dāng)您確認(rèn)探針設(shè)計(jì)后，需要訂購這一產(chǎn)品，只需在系統(tǒng)中點(diǎn)擊Transmit，我們就會(huì)收到您的訂購需求，與您進(jìn)一步聯(lián)系。NimbleDesign軟件設(shè)計(jì)流程
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