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安捷倫科技將生物信息學(xué)系統(tǒng)擴(kuò)展為綜合生物學(xué)套裝

   2011-12-02 中國(guó)化工儀器網(wǎng)1015

      2010年 11 月 15 日,北京 — 安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日發(fā)布了GeneSpring GX 11.5,這是廣泛使用的生物信息學(xué)軟件的擴(kuò)展版,能夠?qū)Χ喾N類(lèi)型的生物學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化和分析。目前 GeneSpring GX 11.5 是首款可同時(shí)對(duì)外顯子芯片、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行解讀的軟件,該工具的界面與以前的版本類(lèi)似。

  這些新功能與現(xiàn)有的 GeneSpring GX 應(yīng)用相結(jié)合,用于基因表達(dá)分析、基因組拷貝數(shù)分析、全基因組關(guān)聯(lián)分析以及轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析。

  安捷倫副總裁兼生物系統(tǒng)部總經(jīng)理 Gustavo Salem 說(shuō):“安捷倫致力于提供精密的新型儀器和軟件工具,以幫助研究人員實(shí)現(xiàn)系統(tǒng)生物學(xué)的美好前景。這個(gè)多組學(xué)生物信息學(xué)軟件只是我們致力于推動(dòng)未來(lái)生物醫(yī)學(xué)研究突破的一部分?!?/FONT>

  Agilent GeneSpring GX 11.5 是與 Strand Scientific Intelligence 公司聯(lián)合研發(fā)的,基于 Strand的 Avadis技術(shù)平臺(tái)之上,該平臺(tái)專(zhuān)門(mén)為科學(xué)家簡(jiǎn)化和應(yīng)對(duì)復(fù)雜的生命科學(xué)挑戰(zhàn)而設(shè)計(jì)。

  GeneSpring GX 11.5 增加了用于選擇性剪接、代謝組學(xué)和蛋白組學(xué)分析的新功能,還改進(jìn)了現(xiàn)有的分析和可視化工具。

  在基因組學(xué)方面,GeneSpring GX 11.5 的剪接分析得到了極大的擴(kuò)展與改進(jìn),可支持新推出的安捷倫外顯子芯片平臺(tái)。借助 Agilent SurePrint G3 外顯子芯片,研究人員可在一次實(shí)驗(yàn)同時(shí)鑒別出基因水平和外顯子水平的表達(dá)差異,從而捕獲到微小但至關(guān)重要的生物變化。使用安捷倫 GeneSpring GX 11.5 生物信息學(xué)系統(tǒng),研究人員可同時(shí)分析基因水平和外顯子剪接水平的數(shù)據(jù),在生物學(xué)環(huán)境中理解復(fù)雜的基因表達(dá)行為,從而提高效率,加速研究進(jìn)程。

  GeneSpring GX 11.5 集成了 Agilent Mass Profiler Professional,從而增加了全新的代謝組學(xué)和蛋白組學(xué)分析功能,并能在 GeneSpring 平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)安捷倫質(zhì)譜分析的所有功能。現(xiàn)在研究者可以在同一窗口中加載多種分別代表了轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、代謝組學(xué)和蛋白組學(xué)的實(shí)驗(yàn)類(lèi)型。這樣用戶(hù)就可以在多個(gè)實(shí)驗(yàn)間切換自如,不再需要單獨(dú)加載各個(gè)實(shí)驗(yàn)。

  這種組織方式還使得研究者進(jìn)行生物學(xué)研究時(shí),可以便捷地將多類(lèi)數(shù)據(jù)結(jié)合到一個(gè)邏輯單元中,并同時(shí)比較不同實(shí)驗(yàn)類(lèi)型的結(jié)果。

  GeneSpring 的一個(gè)重要特點(diǎn)是用戶(hù)可方便地比較異構(gòu)數(shù)據(jù),并且能深入地進(jìn)行生物學(xué)處境化。不同芯片平臺(tái)和有機(jī)體間的探針自動(dòng)翻譯使得研究者可以通過(guò)簡(jiǎn)單的拖放功能,進(jìn)行結(jié)果比較。這項(xiàng)無(wú)縫翻譯技術(shù)使研究者可以快速鑒別具有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著重復(fù)內(nèi)容的實(shí)體列表。

  GeneSpring 11.5 版本為客戶(hù)增加了先進(jìn)的數(shù)據(jù)管理功能,如綜合備份工具和改進(jìn)的數(shù)據(jù)遷移工具。它還整合了 GeneGo 的MetaCore 路徑分析工具,使 GeneSpring 的統(tǒng)計(jì)分析與 MetaCore 的路徑分析優(yōu)勢(shì)得以強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合。

 
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